MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 plasmid pBOT3502

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009496	TCC	2	6	3593	3598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009496	T	6	6	3599	3604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009496	ATT	2	6	3605	3610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009496	TTAA	2	8	3615	3622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009496	AAG	2	6	3665	3670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009496	TAT	2	6	3684	3689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009496	AT	3	6	3719	3724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009496	TCA	2	6	4036	4041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009496	AATT	2	8	4050	4057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009496	AAT	2	6	4068	4073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009496	TTA	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009496	AATT	2	8	4110	4117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009496	ACA	2	6	4132	4137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009496	TAA	2	6	4194	4199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009496	TAAA	2	8	4211	4218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009496	A	6	6	4222	4227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009496	TA	3	6	4245	4250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009496	ATA	3	9	4248	4256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009496	AT	3	6	4278	4283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009496	AT	5	10	4293	4302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009496	TA	4	8	4326	4333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009496	ATT	2	6	4335	4340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009496	CATA	2	8	4574	4581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009496	ACA	2	6	4585	4590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009496	A	7	7	4596	4602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009496	ATG	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009496	T	6	6	4700	4705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009496	ATT	2	6	4706	4711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009496	ATGTAA	2	12	4729	4740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009496	TAT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009496	ATGT	2	8	4777	4784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009496	TGC	2	6	5355	5360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009496	TATT	2	8	5365	5372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009496	ATA	2	6	5402	5407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009496	AT	3	6	5427	5432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009496	TAT	2	6	5445	5450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009496	TAT	2	6	5456	5461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009496	TA	3	6	6126	6131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009496	TTATAT	2	12	6168	6179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009496	ATTAAA	2	12	6180	6191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009496	T	6	6	6204	6209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009496	A	6	6	6214	6219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009496	TAT	2	6	6250	6255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009496	TAT	2	6	6270	6275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009496	ATTT	2	8	6285	6292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009496	T	6	6	6290	6295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009496	ATAA	2	8	6296	6303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009496	TTA	2	6	6583	6588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009496	AT	3	6	6593	6598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009496	GGT	2	6	6610	6615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009496	A	7	7	6875	6881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009496	TAG	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009496	TTA	2	6	6897	6902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009496	AT	3	6	7288	7293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009496	TTTAA	2	10	7306	7315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009496	AAG	2	6	7409	7414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009496	TGA	2	6	7427	7432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009496	AGAATA	2	12	7449	7460	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009496	TAT	2	6	7463	7468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009496	ATA	2	6	7475	7480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009496	AAT	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009496	GCACA	2	10	7552	7561	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_009496	T	6	6	7645	7650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009496	TTA	2	6	7687	7692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009496	AGG	2	6	7693	7698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009496	AAAG	2	8	8990	8997	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009496	A	6	6	9055	9060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009496	ACA	2	6	9177	9182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009496	AG	3	6	9224	9229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009496	ACGG	2	8	9510	9517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009496	A	7	7	9628	9634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009496	T	6	6	9653	9658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009496	T	7	7	9663	9669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009496	ATA	2	6	9953	9958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009496	ATCA	2	8	9969	9976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009496	ATA	2	6	11331	11336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009496	TA	3	6	11335	11340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009496	AAT	2	6	11356	11361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009496	TATC	2	8	11365	11372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009496	A	8	8	11390	11397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009496	TA	4	8	11398	11405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009496	T	6	6	11457	11462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009496	AGAA	2	8	11471	11478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009496	T	6	6	11508	11513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009496	GAT	2	6	11706	11711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009496	TAT	2	6	11728	11733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009496	ATT	2	6	11734	11739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009496	TAC	2	6	11820	11825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009496	T	6	6	11855	11860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009496	TTA	2	6	11883	11888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009496	TAAA	2	8	14320	14327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009496	TAGA	2	8	14337	14344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009496	GTA	2	6	14350	14355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009496	TA	3	6	14354	14359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009496	TAT	2	6	14372	14377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009496	AGGA	2	8	14393	14400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009496	TA	4	8	16094	16101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009496	TA	3	6	16118	16123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009496	ATTT	2	8	16124	16131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009496	TAA	2	6	16153	16158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009496	A	6	6	16174	16179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009496	TTA	2	6	16200	16205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009496	AAATTT	2	12	16255	16266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.